杂志社下设《内蒙古社会科学》编辑部、《内蒙古社会科学（蒙古文版）》编辑部、《中国蒙古学（蒙古文）》编辑部、总编室（办公室），负责出版《内蒙古社会科学》《内蒙古社会科学（蒙古文版）》《中国蒙古学（蒙古文）》三种学术期刊。

　　总编：张立伟

　　副总编：萨其拉

　　总编室（办公室）主任：靳虹舒